美国FBI探员福克斯·穆德（大卫·楚尼 David Duchovny 饰）童年时曾经历起离奇神秘的绑架，他的妹妹萨曼莎睡梦中被外星人劫，至今下落不明。此穆德便专注于神事件的研究，并专负责FBI总部的X档案部门。因穆德事乖张，难以驾驭FBI高层从联邦调查局学院调来女性员黛娜·斯科莉（莲·安德森 Gillian Anderson 饰），表面上是协助穆德工，实际上是希望这崇尚科学的理性探能够制约穆德的行。两人最初的合作不理想，完全不同思维模式时刻导致论的爆发。但随着种离奇案件的出现及两人交往的加深穆德和斯科莉最终成可以为对方出生死的可靠伙伴……　本片荣获1996~1999年度美国作曲家、作家及出商协会影视音乐奖视剧集第一名以及他电影节近70个奖项�